Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
PTCH1Q13635 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PTCH1Q13635 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTCH1Q13635 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTCH1Q13635 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTCH1Q13635 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTCH1Q13635 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTCH1Q13635 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTCH1Q13635 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTCH1Q13635 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTCH1Q13635 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTCH1Q13635 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTCH1Q13635 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PTCH1Q13635 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PTCH1Q13635 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTCH1Q13635 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTCH1Q13635 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTCH1Q13635 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTCH1Q13635 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PTCH1Q13635 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTCH1Q13635 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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