Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121 ms