Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
XRCC4Q13426 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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