Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
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ITGB3BPQ13352 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
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ITGB3BPQ13352 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
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ITGB3BPQ13352 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
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ITGB3BPQ13352 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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ITGB3BPQ13352 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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ITGB3BPQ13352 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
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ITGB3BPQ13352 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
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ITGB3BPQ13352 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ITGB3BPQ13352 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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