Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SKP2Q13309 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms