Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
NME3Q13232 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
NME3Q13232 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NME3Q13232 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NME3Q13232 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NME3Q13232 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NME3Q13232 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NME3Q13232 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NME3Q13232 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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NME3Q13232 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NME3Q13232 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NME3Q13232 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NME3Q13232 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NME3Q13232 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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NME3Q13232 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NME3Q13232 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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NME3Q13232 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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NME3Q13232 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NME3Q13232 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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