Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
IFT88Q13099 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.9 ms