Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ECH1Q13011 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ECH1Q13011 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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