Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIK3Q13003 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIK3Q13003 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIK3Q13003 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIK3Q13003 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIK3Q13003 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIK3Q13003 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIK3Q13003 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIK3Q13003 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GRIK3Q13003 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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GRIK3Q13003 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
GRIK3Q13003 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
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