Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HTATSF1O43719 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HTATSF1O43719 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HTATSF1O43719 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HTATSF1O43719 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HTATSF1O43719 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms