Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TIMM44O43615 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TIMM44O43615 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TIMM44O43615 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TIMM44O43615 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
TIMM44O43615 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TIMM44O43615 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms