Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COPS7AQ9UBW8 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms