Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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