Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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TMOD3Q9NYL9 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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TMOD3Q9NYL9 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TMOD3Q9NYL9 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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TMOD3Q9NYL9 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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TMOD3Q9NYL9 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TMOD3Q9NYL9 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TMOD3Q9NYL9 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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TMOD3Q9NYL9 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TMOD3Q9NYL9 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TMOD3Q9NYL9 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TMOD3Q9NYL9 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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TMOD3Q9NYL9 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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TMOD3Q9NYL9 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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TMOD3Q9NYL9 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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TMOD3Q9NYL9 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TMOD3Q9NYL9 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TMOD3Q9NYL9 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TMOD3Q9NYL9 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TMOD3Q9NYL9 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TMOD3Q9NYL9 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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