Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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CCL28Q9NRJ3 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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CCL28Q9NRJ3 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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CCL28Q9NRJ3 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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CCL28Q9NRJ3 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
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CCL28Q9NRJ3 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
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CCL28Q9NRJ3 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCL28Q9NRJ3 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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