Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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MS4A4AQ96JQ5 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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MS4A4AQ96JQ5 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MS4A4AQ96JQ5 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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MS4A4AQ96JQ5 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
MS4A4AQ96JQ5 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
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MS4A4AQ96JQ5 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MS4A4AQ96JQ5 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MS4A4AQ96JQ5 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MS4A4AQ96JQ5 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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MS4A4AQ96JQ5 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MS4A4AQ96JQ5 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MS4A4AQ96JQ5 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MS4A4AQ96JQ5 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MS4A4AQ96JQ5 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MS4A4AQ96JQ5 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MS4A4AQ96JQ5 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MS4A4AQ96JQ5 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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MS4A4AQ96JQ5 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MS4A4AQ96JQ5 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MS4A4AQ96JQ5 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MS4A4AQ96JQ5 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MS4A4AQ96JQ5 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MS4A4AQ96JQ5 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MS4A4AQ96JQ5 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MS4A4AQ96JQ5 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MS4A4AQ96JQ5 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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