Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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CCDC47Q96A33 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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CCDC47Q96A33 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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CCDC47Q96A33 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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CCDC47Q96A33 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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CCDC47Q96A33 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
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CCDC47Q96A33 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
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CCDC47Q96A33 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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CCDC47Q96A33 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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