Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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TRAF7Q6Q0C0 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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TRAF7Q6Q0C0 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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TRAF7Q6Q0C0 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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TRAF7Q6Q0C0 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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TRAF7Q6Q0C0 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF7Q6Q0C0 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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