Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
FSCN1Q16658 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.9 ms