Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
NRF1Q16656 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NRF1Q16656 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms