Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SGCBQ16585 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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SGCBQ16585 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
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SGCBQ16585 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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SGCBQ16585 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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SGCBQ16585 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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SGCBQ16585 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SGCBQ16585 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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