Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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SNAPC1Q16533 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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SNAPC1Q16533 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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SNAPC1Q16533 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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SNAPC1Q16533 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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SNAPC1Q16533 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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SNAPC1Q16533 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SNAPC1Q16533 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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