Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNGA3Q16281 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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