Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CCDC6Q16204 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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