Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
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ALX1Q15699 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
ALX1Q15699 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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