Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SS18Q15532 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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SS18Q15532 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SS18Q15532 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
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SS18Q15532 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
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SS18Q15532 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SS18Q15532 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
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SS18Q15532 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SS18Q15532 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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SS18Q15532 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SS18Q15532 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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SS18Q15532 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SS18Q15532 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SS18Q15532 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SS18Q15532 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SS18Q15532 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SS18Q15532 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SS18Q15532 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SS18Q15532 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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