Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SKIV2LQ15477 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SKIV2LQ15477 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms