Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SIX1Q15475 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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SIX1Q15475 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
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SIX1Q15475 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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SIX1Q15475 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
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SIX1Q15475 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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SIX1Q15475 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SIX1Q15475 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SIX1Q15475 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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