Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHHQ15465 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SHHQ15465 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHHQ15465 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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