Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SHBQ15464 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms