Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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