Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
BRD3Q15059 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms