Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC3Q15034 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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