Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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