Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDH18Q13634 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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