Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
XRCC4Q13426 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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