Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SP140Q13342 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SP140Q13342 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SP140Q13342 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms