Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SGCGQ13326 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.2 ms