Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
SRSF6Q13247 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SRSF6Q13247 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms