Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ERCC8Q13216 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ERCC8Q13216 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms