Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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CBX3Q13185 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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CBX3Q13185 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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CBX3Q13185 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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CBX3Q13185 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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CBX3Q13185 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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CBX3Q13185 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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CBX3Q13185 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CBX3Q13185 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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