Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHAF1BQ13112 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms