Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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GPS1Q13098 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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GPS1Q13098 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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GPS1Q13098 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GPS1Q13098 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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