Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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TRAF1Q13077 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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TRAF1Q13077 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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TRAF1Q13077 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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TRAF1Q13077 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
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TRAF1Q13077 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
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TRAF1Q13077 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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TRAF1Q13077 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
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TRAF1Q13077 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
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TRAF1Q13077 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
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