Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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STRN3Q13033 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
STRN3Q13033 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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