Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC0.12□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.11□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC0.09□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CENPEQ02224 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CENPEQ02224 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms