Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
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PTPRBP23467 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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PTPRBP23467 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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PTPRBP23467 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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PTPRBP23467 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
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PTPRBP23467 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
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PTPRBP23467 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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PTPRBP23467 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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