Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CSO75390 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CSO75390 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CSO75390 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
CSO75390 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
CSO75390 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
CSO75390 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CSO75390 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CSO75390 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.57□□□□□ -2
CSO75390 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSO75390 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CSO75390 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CSO75390 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSO75390 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms