Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
LRRTM2O43300 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LRRTM2O43300 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LRRTM2O43300 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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