Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SOBPA7XYQ1 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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